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用于單分子長(zhǎng)讀取測(cè)序的高分子量基因組DNA的提取方法
點(diǎn)擊次數(shù):2981 更新時(shí)間:2016-11-24

復(fù)雜基因組從頭測(cè)序是研究人員尋求高質(zhì)量參照序列的主要挑戰(zhàn)之一,許多從頭組裝都是基于短序列,組裝成片段的基因組序列。第三代測(cè)序技術(shù)的讀取長(zhǎng)度大于10 Kb,這將有利于復(fù)雜基因組的組裝,但是這些技術(shù)要求高分子量的基因組DNA,常用的基因組DNA提取方法所提取到的基因組DNA可用于獲取較小片段并進(jìn)行短讀取測(cè)序,但是這些基因組DNA并不適用于第三代測(cè)序技術(shù)。利用細(xì)菌人工染色體構(gòu)建基因文庫(kù)的方法也許適用,但是這些方法不但耗時(shí),而且用于這些方法的試劑盒較為昂貴。這里,法國(guó)科學(xué)家Baptiste Mayjonade等人提供了一種快速廉價(jià)的從細(xì)菌、植物和動(dòng)物中提取高分子量基因組DNA的方法。這一方法已通過(guò)驗(yàn)證,以向日葵葉子為樣本,其平均讀取長(zhǎng)度為12.6 Kb,zui大讀取長(zhǎng)度為80 Kb。

 原文:

Baptiste Mayjonade, Jérôme Gouzy, Cécile Donnadieu et al, Extraction of high-molecular-weight genomic DNA for long-read sequencing of single molecules. BioTechniques 61:203-205 (October 2016).

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